Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccl7Q03366 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccl7Q03366 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms