Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Runx1Q03347 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms