Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mmp11Q02853 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mmp11Q02853 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms