Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gjb5Q02739 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gjb5Q02739 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms