Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Muc1Q02496 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms