Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ascl1Q02067 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ascl1Q02067 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ascl1Q02067 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ascl1Q02067 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ascl1Q02067 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ascl1Q02067 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ascl1Q02067 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ascl1Q02067 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ascl1Q02067 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ascl1Q02067 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ascl1Q02067 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ascl1Q02067 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ascl1Q02067 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms