Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Hoxd1Q01822 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hoxd1Q01822 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
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Hoxd1Q01822 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hoxd1Q01822 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hoxd1Q01822 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hoxd1Q01822 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Hoxd1Q01822 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Hoxd1Q01822 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms