Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gjb2Q00977 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms