Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Serpina1cQ00896 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Serpina1cQ00896 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms