Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Itga4Q00651 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Itga4Q00651 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms