Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gabpb1Q00420 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gabpb1Q00420 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms