Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gata5P97489 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gata5P97489 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms