Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ccl21cP86793 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ccl21cP86793 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ccl21cP86793 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccl21cP86793 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccl21cP86793 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ccl21cP86793 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccl21cP86793 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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