Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irf3P70671 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irf3P70671 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irf3P70671 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irf3P70671 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irf3P70671 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irf3P70671 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irf3P70671 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irf3P70671 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irf3P70671 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irf3P70671 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irf3P70671 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irf3P70671 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irf3P70671 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irf3P70671 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irf3P70671 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irf3P70671 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irf3P70671 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Irf3P70671 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Irf3P70671 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms