Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gfi1P70338 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms