Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxd13P70217 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Hoxd13P70217 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms