Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Plxna3P70208 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Plxna3P70208 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms