Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Traf5P70191 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Traf5P70191 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Traf5P70191 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms