Protein–RNA interactions for Protein: P68373

Tuba1c, Tubulin alpha-1C chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba1cP68373 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tuba1cP68373 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tuba1cP68373 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms