Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Arf6P62331 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf6P62331 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf6P62331 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf6P62331 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Arf6P62331 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms