Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufm1P61961 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufm1P61961 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms