Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfia3P60469 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfia3P60469 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms