Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smpdl3bP58242 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms