Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samsn1P57725 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms