Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp25P57080 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp25P57080 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp25P57080 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms