Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CckbrP56481 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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