Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Aqp4P55088 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms