Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ephb3P54754 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ephb3P54754 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms