Protein–RNA interactions for Protein: P54279

Pms2, Mismatch repair endonuclease PMS2, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms2P54279 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pms2P54279 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms