Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PctpP53808 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PctpP53808 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PctpP53808 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PctpP53808 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PctpP53808 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PctpP53808 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PctpP53808 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PctpP53808 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms