Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fdft1P53798 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fdft1P53798 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms