Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TspoP50637 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TspoP50637 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TspoP50637 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TspoP50637 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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