Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LtbrP50284 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LtbrP50284 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms