Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cav1P49817 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms