Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psen1P49769 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms