Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtpreP49446 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtpreP49446 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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