Protein–RNA interactions for Protein: P48725

Pcnt, Pericentrin, mousemouse

Predictions only

Length 2,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcntP48725 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcntP48725 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PcntP48725 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PcntP48725 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcntP48725 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcntP48725 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcntP48725 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcntP48725 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PcntP48725 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PcntP48725 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcntP48725 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcntP48725 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PcntP48725 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PcntP48725 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PcntP48725 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PcntP48725 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PcntP48725 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms