Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl13P47963 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl13P47963 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms