Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Resp18P47939 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Resp18P47939 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Resp18P47939 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Resp18P47939 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Resp18P47939 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Resp18P47939 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms