Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zic1P46684 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zic1P46684 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms