Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkn1bP46414 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms