Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdh4P39038 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdh4P39038 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdh4P39038 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdh4P39038 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms