Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sar1aP36536 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sar1aP36536 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sar1aP36536 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sar1aP36536 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sar1aP36536 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms