Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoc1P34928 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoc1P34928 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoc1P34928 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Apoc1P34928 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Apoc1P34928 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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