Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PtprmP28828 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PtprmP28828 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprmP28828 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprmP28828 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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