Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Defa3P28310 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa3P28310 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms