Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
LoxP28301 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LoxP28301 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LoxP28301 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LoxP28301 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
LoxP28301 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LoxP28301 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LoxP28301 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms