Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb3P28231 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms