Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms