Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
H2afxP27661 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2afxP27661 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms